Suy ra hoạt động không cân bằng phụ thuộc vào quy mô bằng cách sử dụng ống nano carbon

Needleman, D. & Dogic, Z. Vật chất tích cực ở giao diện giữa khoa học vật liệu và sinh học tế bào. Nat. Mục sư 2, 17048 (2017).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Ramaswamy, S. Cơ học và số liệu thống kê về vật chất hoạt động. Annu. Rev. Condens. Vật chất Phys. 1, 323 tầm 345 (2010).

Bài báo  Google Scholar 

Marchetti, M. và cộng sự. Thủy động lực học của vật chất hoạt tính mềm. Rev. Vật lý. 85, 1143 tầm 1189 (2013).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Bowick, M., Fakhri, N., Marchetti, M. & Ramaswamy, S. Đối xứng, nhiệt động lực học và cấu trúc liên kết trong vật chất hoạt động. Vật lý. Mục sư X 12, 010501 (2022).

CAS  Google Scholar 

Yang, X. và cộng sự. Năng lượng sinh học vật lý: dòng năng lượng, ngân sách và các ràng buộc trong tế bào. Proc. Học viện Natl. Khoa học Hoa Kỳ 118, e2026786118 (2021).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Tân, T. và cộng sự. Các kiểu căng thẳng tự tổ chức thúc đẩy quá trình chuyển đổi trạng thái trong vỏ Actin. Khoa học. Tư vấn. 4, ear2847 (2018).

Bài báo  Google Scholar 

Gladrow, J., Fakhri, N., MacKintosh, FC, Schmidt, CF & Broedersz, CP Đã phá vỡ sự cân bằng chi tiết của động lực dây tóc trong các mạng đang hoạt động. Vật lý. Mục sư Lett. 116, 248301 (2016).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Landau, L., Lifshitz, E., Sykes, J., & Reid, W. Lý thuyết đàn hồi (Addison-Wesley 1959).

Brangwynne, CP, Koenderink, GH, MacKintosh, FC & Weitz, DA Sự dao động của vi ống không cân bằng trong khung tế bào mô hình. Vật lý. Mục sư Lett. 100, 118104 (2008).

Bài báo  Google Scholar 

Anh, JL Thích ứng tiêu tán trong tự lắp ráp có điều khiển. Nat. Công nghệ nano. 10, 919 tầm 923 (2015).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Mizuno, D., Tardin, C., Schmidt, CF & MacKintosh, FC Cơ chế không cân bằng của các mạng lưới tế bào hoạt động. Khoa học 315, 370 tầm 373 (2007).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Trận chiến, C. et al. Cân bằng chi tiết bị phá vỡ ở quy mô siêu âm trong các hệ thống sinh học đang hoạt động. Khoa học 352, 604 tầm 607 (2016).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Egolf, DA Lấy lại trạng thái cân bằng: từ sự hỗn loạn không cân bằng đến cơ học thống kê. Khoa học 287, 101 tầm 104 (2000).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Prost, J., Jülicher, F. & Joanny, JF. Vật lý gel hoạt tính. Nat. Vật lý. 11, 111 tầm 117 (2015).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

O'Byrne, J., Kafri, Y., Tailleur, J. & van Wijland, F. Tính không thể đảo ngược của thời gian trong vật chất hoạt động, từ vi mô đến vĩ mô. tự nhiên Mục sư Phys. 4, 167 tầm 183 (2022).

Bài báo  Google Scholar 

Gnesotto, FS, Mura, F., Gladrow, J. & Broedersz, CP Bị hỏng cân bằng chi tiết và động lực không cân bằng trong các hệ thống sống: đánh giá. Đại diện Prog. Thể chất. 81, 066601 (2018).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Fakhri, N. và cộng sự. Lập bản đồ độ phân giải cao của dao động nội bào bằng cách sử dụng ống nano cacbon. Khoa học 344, 1031 tầm 1035 (2014).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Fakhri, N., Tsyboulski, DA, Cognet, L., Weisman, RB & Pasquali, M. Động lực uốn phụ thuộc vào đường kính của ống nano carbon đơn vách trong chất lỏng. Proc. Học viện Natl. Khoa học Hoa Kỳ 106, 14219 tầm 14223 (2009).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Fakhri, N., MacKintosh, FC, Lounis, B., Cognet, L. & Pasquali, M. Brownian chuyển động của các sợi cứng trong một môi trường đông đúc. Khoa học 330, 1804 tầm 1807 (2010).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Murrell, MP & Gardel, ML F-actin oằn xuống phối hợp khả năng co bóp và cắt đứt trong vỏ não Actomyosin mô phỏng sinh học. Proc. Học viện Natl. Khoa học Hoa Kỳ 109, 20820 tầm 20825 (2012).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Weiss, JB Phối hợp bất biến trong các hệ thống động ngẫu nhiên. Tellus A 55, 208 tầm 218 (2003).

Bài báo  Google Scholar 

Crooks, Định lý dao động sản xuất Entropy của GE và mối quan hệ công việc không cân bằng đối với sự khác biệt năng lượng tự do. vật lý. Mục sư E 60, 2721 tầm 2726 (1999).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Ro, S. và cộng sự. Đo lường không có mô hình về sản xuất entropy cục bộ và công việc có thể trích xuất được trong vật chất hoạt động. Vật lý. Mục sư Lett. 129, 220601 (2022).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Harunari, P. E., Dutta, A., Polettini, M. & Roldán, É. What to learn from a few visible transitions’ statistics? Vật lý. Mục sư X 12, 041026 (2022).

CAS  Google Scholar 

van der Meer, J., Ertel, B. & Seifert, U. Suy luận nhiệt động lực học trong các mạng Markov có thể truy cập một phần: một quan điểm thống nhất từ ​​các phân phối thời gian chờ dựa trên quá trình chuyển đổi. In trước tại https://arxiv.org/abs/2203.07427 (2022).

van der Meer, J., Degünther, J. & Seifert, U. Số liệu thống kê được giải quyết theo thời gian của các đoạn trích dưới dạng khuôn khổ chung cho các công cụ ước tính entropy không có mô hình. In trước tại https://arxiv.org/abs/2211.17032 (2022).

Roldán, E., Barral, J., Martin, P., Parrondo, JMR & Jülicher, F. Định lượng sản xuất entropy trong các dao động tích cực của bó tế bào tóc theo thời gian không thể đảo ngược và các mối quan hệ không chắc chắn. Mới J. Phys. 23, 083013 (2021).

Bài báo  Google Scholar 

Tucci, G. và cộng sự. Mô hình hóa các dao động phi Markovian đang hoạt động. Vật lý. Mục sư Lett. 129, 030603 (2022).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Skinner, DJ & Dunkel, J. Cải thiện các giới hạn về sản xuất entropy trong các hệ thống sống. Proc. Học viện Natl. Khoa học Hoa Kỳ 118, e2024300118 (2021).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Weiss, JB, Fox-Kemper, B., Mandal, D., Nelson, AD & Zia, RKP Dao động không cân bằng, xung lượng góc xác suất và hệ thống khí hậu. J. Thống kê. vật lý. 179, 1010 tầm 1027 (2020).

Bài báo  Google Scholar 

Gonzalez, JP, Neu, JC & Teitsworth, SW Số liệu thử nghiệm để phát hiện vi phạm số dư chi tiết. vật lý. Mục sư E 99, 022143 (2019).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Zia, RKP, Weiss, JB, Mandal, D. & Fox-Kemper, B. Hành vi tuần hoàn tinh tế và rõ ràng ở các trạng thái ổn định không cân bằng. J. Vật lý. Conf. Ser. 750, 012003 (2016).

Bài báo  Google Scholar 

Li, J., Horowitz, JM, Gingrich, TR & Fakhri, N. Định lượng sự tiêu tán bằng dòng dao động. Nat. Cộng đồng. 10, 1666 (2019).

Bài báo  Google Scholar 

Guo, M. và cộng sự. Thăm dò các đặc tính ngẫu nhiên, điều khiển bằng động cơ của tế bào chất bằng kính hiển vi quang phổ lực. Pin 158, 822 tầm 832 (2014).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

MacKintosh, FC & Levine, AJ Cơ học không cân bằng và động lực học của gel kích hoạt bằng động cơ. Vật lý. Mục sư Lett. 100, 018104 (2008).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Malik-Garbi, M. et al. Hành vi mở rộng quy mô trong các mạng lưới Actomyosin hợp đồng ở trạng thái ổn định. Nat. Vật lý. 15, 509 tầm 516 (2019).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

MacKintosh, FC, Käs, J. & Janmey, PA Tính đàn hồi của mạng polyme sinh học bán linh hoạt. Vật lý. Mục sư Lett. 75, 4425 tầm 4428 (1995).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Valentine, MT, Perlman, ZE, Mitchison, TJ & Weitz, DA Tính chất cơ học của xenopus dịch chiết tế bào chất của trứng. Sinh lý. J. 88, 680 tầm 689 (2005).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Field, CM, Pelletier, JF & Mitchison, TJ trong Phương pháp trong sinh học tế bào: Cytokinesis tập 137 (ed. Echard, A.) 395–435 (Academic, 2017).

Riedl, J. và cộng sự. Lifeact: một điểm đánh dấu linh hoạt để hình dung F-actin. Nat. Phương pháp 5, 605 tầm 607 (2008).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Chen, DT, Heymann, M., Fraden, S., Nicastro, D. & Dogic, Z. Mức tiêu thụ ATP của Flagella sinh vật nhân chuẩn được đo ở cấp độ đơn bào. Sinh lý. J. 109, 2562 tầm 2573 (2015).

Bài báo  CAS  Google Scholar 

Ruhnow, F., Zwicker, D. & Diez, S. Theo dõi các hạt đơn lẻ và sợi dài với độ chính xác nanomet. Sinh lý. J. 100, 2820 tầm 2828 (2011).

Bài báo  CAS  Google Scholar