Eine benutzerfreundliche Plattform ist ein Tor zur KI in der Mikroskopie

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Beispiel, das zeigt, wie AI über ZeroCostDL4Mic verwendet werden kann, um den Kern von Krebszellen anhand von Mikroskopbildern zu erfassen. Oberes Bild: Originalmikroskopbild. Unteres Bild: Bild, in dem jede erkannte Krebszelle eine andere Farbe hat. Bilder: Guillaume Jacquemet.

Abstract:
Software mit künstlicher Intelligenz (KI) revolutioniert die Analyse von Mikroskopbildern. Beispielsweise kann AI verwendet werden, um Merkmale in Bildern (dh Tumoren in Biopsieproben) zu erkennen oder die Bildqualität zu verbessern, indem unerwünschtes Rauschen entfernt wird. Nicht-Experten finden es jedoch weiterhin schwierig, KI-Technologien zu verwenden.

Eine benutzerfreundliche Plattform ist ein Tor zur KI in der Mikroskopie

Turku, Finnland | Veröffentlicht am 23. April 2021

In dem am 4. April 15 in Nature Communications veröffentlichten Artikel „Demokratisierung von Deep Learning für die Mikroskopie mit ZeroCostDL2021Mic“ beschreiben Forscher eine Plattform namens ZeroCostDL4Mic, die diese KI-Technologien für jedermann zugänglich macht.

„Die wichtigste Neuerung ist, dass ZeroCostDL4Mic kostenlos in der Cloud ausgeführt wird und keine Programmiererfahrung oder fortgeschrittene Rechenkenntnisse erforderlich sind. Tatsächlich läuft es auf jedem Computer, der über einen Webbrowser verfügt “, sagt Guillaume Jacquemet, Senior Researcher für Zellbiologie an der Åbo Akademi University.

In den letzten 400 Jahren haben Mikroskope es der Menschheit ermöglicht, Objekte zu beobachten, die ansonsten zu klein sind, um mit bloßem Auge gesehen zu werden. Heute ist die Mikroskopie eine weltweit führende Technologie, mit der nicht nur Forschung, sondern auch Diagnostik betrieben wird.

Moderne Mikroskope sind direkt mit Digitalkameras verbunden, was zur Erfassung von Hunderten bis Tausenden von Bildern pro Probe führt. Diese Bilder müssen auf einem Computer verarbeitet werden, um aussagekräftige Daten zu erhalten, was ein großes Unterfangen ist.

Um die Anzahl der Bilder zu verbessern, haben Jacquemet und seine Kollegen AI verwendet, um eine Maschine für die Arbeit zu trainieren. In der Praxis ist ZeroCostDL4Mic eine Sammlung selbsterklärender Notizbücher für Google Colab mit einer benutzerfreundlichen grafischen Benutzeroberfläche.

"Wir glauben, dass ZeroCostDL4Mic als" Gateway-Medikament "für KI fungieren wird und die Benutzer dazu verleiten wird, diese neuen Technologien zu erforschen, die die biomedizinische Forschung und Diagnostik in den kommenden Jahrzehnten verändern werden", sagt Jacquemet.

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Die Entwicklung der ZeroCostDL4Mic-Plattform wurde von den Labors von Guillaume Jacquemet (Åbo Akademi University, Turku, Finnland) und Ricardo Henriques (Instituto Gulbenkian de Ciência, Oeiras, Portugal) koordiniert. Es handelte sich um ein großes internationales Konsortium mit 12 Laboratorien in neun Ländern und zwei Kontinenten.

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Für weitere Informationen - hier

Kontakte:
Guillaume Jaquemet
358-503-235-606

@aboakademi

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