Assosierer vekstfaktorsekresjoner og transkriptomer av enkeltceller i nanovialer ved bruk av SEC-seq – Nature Nanotechnology

Uhlén, M. et al. Vevsbasert kart over det menneskelige proteomet. Vitenskap 347, 1260419-1260419 (2015).

Artikkel 

Google Scholar 

Miwa, H., Dimatteo, R., de Rutte, J., Ghosh, R. & Di Carlo, D. Enkeltcellesortering basert på utskilte produkter for funksjonelt definerte celleterapier. Mikrosystem. Nanoeng. 8, 84 (2022).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Levy, O. et al. Knusende barrierer mot klinisk meningsfulle MSC-terapier. Sci. Adv. 6, eaba6884 (2020).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Kode, JA, Mukherjee, S., Joglekar, MV & Hardikar, AA Mesenkymale stamceller: immunbiologi og rolle i immunmodulering og vevsregenerering. Cytoterapi 11, 377-391 (2009).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Bode, D., Cull, AH, Rubio-Lara, JA & Kent, DG Utnytter enkeltcelleverktøy i gen- og celleterapi. Front. Immunol. 12, 2775 (2021).

Artikkel 

Google Scholar 

Lee, S., De Rutte, J., Dimatteo, R., Koo, D. & Di Carlo, D. Skalerbar fabrikasjon og bruk av 3D-strukturerte mikropartikler romlig funksjonalisert med biomolekyler. ACS Nano 16, 38-49 (2022).

CAS 

Google Scholar 

De Rutte, J. et al. Suspenderbare hydrogel nanovialer for massivt parallelle enkeltcelle funksjonell analyse og sortering. ACS Nano 16, 7242-7257 (2022).

Google Scholar 

de Rutte, J., Dimatteo, R., Zhu, S., Archang, MM & Di Carlo, D. Sortering av enkeltcellede mikrobærere ved bruk av kommersielle flowcytometre. SLAS Technol. 27, 150-159 (2022).

Artikkel 

Google Scholar 

Stoeckius, M. et al. Samtidig epitop- og transkriptommåling i enkeltceller. Nat. metoder 14, 865-868 (2017).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Peterson, VM et al. Multipleks kvantifisering av proteiner og transkripsjoner i enkeltceller. Nat. Bioteknologi. 35, 936-939 (2017).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Thej, C., Ramadasse, B., Walvekar, A., Majumdar, AS & Balasubramanian, S. Utvikling av en surrogatstyrkeanalyse for å bestemme den angiogene aktiviteten til Stempeucel®, en samlet, ex-vivo utvidet, allogen human benmarg mesenkymalt stromalcelleprodukt. Stamcelle. Res. Ther. 8, 1-14 (2017).

Artikkel 

Google Scholar 

Berry, JD et al. NurOwn, fase 2, randomisert, klinisk studie hos pasienter med ALS. Nevrologi 93, e2294 – e2305 (2019).

Artikkel 

Google Scholar 

Yousefi, K. et al. Designet og begrunnelsen for en fase 2b, randomisert, dobbeltblindet og placebokontrollert studie for å evaluere sikkerheten og effekten av lomecel-B hos eldre voksne med skrøpelighet. J. Skrøpelighet Aldring 11, 214-223 (2022).

CAS 

Google Scholar 

Mereu, E. et al. Benchmarking av encellede RNA-sekvenseringsprotokoller for celleatlasprosjekter. Nat. Bioteknologi. 38, 747-755 (2020).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Koch, F. et al. Generisk metode for utskriftsvindujustering for ekstruderingsbasert 3D-bioprinting for å opprettholde høy levedyktighet av mesenkymale stamceller i en alginat-gelatinhydrogel. bioprinting 20, e00094 (2020).

Artikkel 

Google Scholar 

Schwartz, MA & Assoian, RK Integriner og celleproliferasjonsregulering av syklinavhengige kinaser via cytoplasmatiske signalveier. J. Cell Sci. 114, 2553-2560 (2001).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Potier, E. et al. Hypoksi påvirker osteogen differensiering av mesenkymal stromalcelle og uttrykk for angiogen faktor. Bein 40, 1078-1087 (2007).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Liu, G.-S. et al. Farmakologisk priming av fettavledede stamceller for parakrin VEGF-produksjon med deferoksamin. J. Tissue Eng. Regen. Med. 10, E167 – E176 (2016).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Waters, JA, Urbano, I., Robinson, M. & House, CD Insulinlignende vekstfaktorbindende protein 5: forskjellige roller i kreft. Front. Oncol. 12, 1052457 (2022).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Sureshbabu, A. et al. IGFBP5 induserer celleadhesjon, øker celleoverlevelse og hemmer cellemigrasjon i MCF-7 humane brystkreftceller. J. Cell Sci. 125, 1693-1705 (2012).

CAS 

Google Scholar 

Al Halawani, A., Abdulkhalek, L., Mithieux, SM & Weiss, AS Tropoelastin fremmer dannelsen av tette, sammenkoblede endotelnettverk. biomolekyler 11, 1318 (2021).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Zheng, H., Fu, G., Dai, T. & Huang, H. Migrering av endoteliale stamceller mediert av stromalcelle-avledet faktor-1alpha/CXCR4 via PI3K/Akt/eNOS signaltransduksjonsvei. J. Cardiovasc. Pharmacol. 50, 274-280 (2007).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Chou, CH et al. SCUBE3-regulering av tidlig lungekreftangiogenese og metastatisk progresjon. Clin. Exp. metastaser 30, 741-752 (2013).

CAS 

Google Scholar 

Fan, D. & Kassiri, Z. Biologi av vevsinhibitor av metalloproteinase 3 (TIMP3), og dens terapeutiske implikasjoner i kardiovaskulær patologi. Front. Physiol. 11, 661 (2020).

Artikkel 

Google Scholar 

Poss, KD & Tonegawa, S. Heme oksygenase 1 er nødvendig for gjenbruk av jern fra pattedyr. Proc. Natl Acad. Sci. USA 94, 10919 (1997).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Lenselink, EA Fibronektins rolle i normal sårheling. Int. Sår J. 12, 313 (2015).

Artikkel 

Google Scholar 

DiFeo, A., Martignetti, JA & Narla, G. Rollen til KLF6 og dens spleisevarianter i kreftbehandling. Resist mot narkotika. Oppdatering. 12, 1-7 (2009).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Higuchi, M. et al. PRRX1- og PRRX2-positive mesenkymale stam-/progenitorceller er involvert i vaskulogenese under utvikling av embryonal hypofyse hos rotter. Cell Vev Res. 361, 557-565 (2015).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Dong, Y. et al. RBPjkappa-avhengig Notch-signalering regulerer mesenkymal progenitorcelleproliferasjon og differensiering under skjelettutvikling. Utvikling 137, 1461-1471 (2010).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Han, H. et al. TRRUST v2: en utvidet referansedatabase over transkripsjonelle regulatoriske interaksjoner mellom mennesker og mus. Nucleic Acids Res. 46, D380 – D386 (2018).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Cheng, RY-H. et al. SEC-seq: assosiasjon av molekylære signaturer med antistoffsekresjon i tusenvis av enkeltstående humane plasmaceller. Nat. Commun. 14, 3567 (2023).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Shum, EY, Walczak, EM, Chang, C. & Christina Fan, H. Kvantifisering av mRNA-transkripsjoner og proteiner ved bruk av BD Rhapsody^TM enkeltcelleanalysesystem. Adv. Exp. Med. Biol. 1129, 63-79 (2019).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Trzupek, D. et al. Oppdagelse av CD80 og CD86 som nyere aktiveringsmarkører på regulatoriske T-celler ved protein-RNA-enkeltcelleanalyse. Genom Med. 12, 55 (2020).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Vanuytsel, K. et al. Multimodal profilering av humane føtale lever hematopoietiske stamceller avslører den molekylære signaturen til engraftment. Nat. Commun. 13, 1103 (2022).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Wu, T. et al. Tidsløst vurdering av encellet proteinsekresjon ved sekvensering. Nat. metoder 20, 723-734 (2023).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Xie, Z. et al. Encellet RNA-sekvenseringsanalyse av humane benmargsavledede mesenkymale stamceller og funksjonell subpopulasjonsidentifikasjon. Exp. Mol. Med. 54, 483-492 (2022).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Sun, C. et al. Enkeltcellet RNA-seq fremhever heterogenitet i humane primære Whartons gelé mesenkymale stam-/stromale celler dyrket in vitro. Stamcelle Res. Ther. 11, 149 (2020).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Zhang, C. et al. Encellet transkriptomisk analyse avslører den cellulære heterogeniteten til mesenkymale stamceller. Genomics Proteom. Bioinform. 20, 70-86 (2022).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Cui, Y. et al. Enkeltcellekarakterisering av monolag dyrkede humane tannmassestamceller med forbedret differensieringskapasitet. Int. J. Oral. Sci. 13, 44 (2021).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Vistain, L. et al. Kvantifisering av ekstracellulære proteiner, proteinkomplekser og mRNA i enkeltceller ved nærhetssekvensering. Nat. metoder 19, 1578-1589 (2022).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Baloh, RH et al. Transplantasjon av humane nevrale stamceller som skiller ut GDNF inn i ryggmargen til pasienter med ALS: en fase 1/2a-studie. Nat. Med. 28, 1813-1822 (2022).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Carraro, G. et al. Transkripsjonsanalyse av cystisk fibrose luftveier ved enkeltcelleoppløsning avslører endrede epitelcelletilstander og sammensetning. Nat. Med. 27, 806-814 (2021).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Chen, G. et al. Omfattende identifikasjon og karakterisering av humant sekretom basert på integrerende proteomiske og transkriptomiske data. Front. Cell Dev. Biol. 7, 299 (2019).

Artikkel 

Google Scholar 

Hu, H. et al. AnimalTFDB 3.0: en omfattende ressurs for merknader og prediksjon av dyretranskripsjonsfaktorer. Nucleic Acids Res. 47, D33 – D38 (2019).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Bausch-Fluck, D. et al. Den in silico menneskelige overflaten. Proc. Natl Acad. Sci. USA 115, E10988 – E10997 (2018).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar