Création de sphéroïdes cellulaires par gélification intercellulaire transcytotique – Nature Nanotechnology

Rookmaaker, MB, Schutgens, F., Verhaar, MC & Clevers, H. Développement et application d'organoïdes de cellules souches ou progénitrices adultes humaines. Nat. Révérend Néphrol. 11, 546 – 554 (2015).

Article  CAS  Google Scholar 

Baharvand, H., Hashemi, SM, Kazemi Ashtiani, S. & Farrokhi, A. Différenciation des cellules souches embryonnaires humaines en hépatocytes dans des systèmes de culture 2D et 3D in vitro. Int. J. Dev. Biol. 50, 645 – 652 (2006).

Article  CAS  Google Scholar 

Benya, PD & Shaffer, JD Les chondrocytes dédifférenciés réexpriment le phénotype différencié du collagène lorsqu'ils sont cultivés dans des gels d'agarose. Cellule 30, 215 – 224 (1982).

Article  CAS  Google Scholar 

Nelson, CM & Bissell, MJ Modélisation de la réciprocité dynamique : ingénierie de modèles culturels tridimensionnels de l'architecture, de la fonction et de la transformation néoplasique du sein. Sémin. Cancer Biol. 15, 342 – 352 (2005).

Article  Google Scholar 

Imamura, Y. et al. Comparaison de modèles de culture 2D et 3D comme plateformes de test de médicaments dans le cancer du sein. Oncol. représentant 33, 1837 – 1843 (2015).

Article  CAS  Google Scholar 

Weaver, VM et coll. Réversion du phénotype malin des cellules mammaires humaines en culture tridimensionnelle et in vivo par anticorps bloquant l'intégrine. J.Cell Biol. 137, 231 – 245 (1997).

Article  CAS  Google Scholar 

Bhadriraju, K. & Chen, CS Ingénierie des microenvironnements cellulaires pour améliorer les tests de médicaments basés sur les cellules. Drug Discov. Aujourd'hui 7, 612 – 620 (2002).

Article  CAS  Google Scholar 

Yamada, KM & Cukierman, E. Modélisation de la morphogenèse tissulaire et du cancer en 3D. Cellule 130, 601 – 610 (2007).

Article  CAS  Google Scholar 

Cukierman, E., Pankov, R., Stevens, DR & Yamada, KM Amener les adhésions cellule-matrice à la troisième dimension. Sciences 294, 1708 – 1712 (2001).

Article  CAS  Google Scholar 

Gao, D. et al. Cultures organoïdes provenant de patients atteints d'un cancer avancé de la prostate. Cellule 159, 176 – 187 (2014).

Article  CAS  Google Scholar 

Karthaus, WR et coll. Identification de cellules progénitrices luminales multipotentes dans des cultures organoïdes de la prostate humaine. Cellule 159, 163 – 175 (2014).

Article  CAS  Google Scholar 

Drost, J. et al. Systèmes de culture organoïde pour les tissus épithéliaux et cancéreux de la prostate. Nat. Protoc. 11, 347 – 358 (2016).

Article  CAS  Google Scholar 

Kelm, JM, Timmins, NE, Brown, CJ, Fussenegger, M. & Nielsen, LK Méthode de génération de sphéroïdes tumoraux multicellulaires homogènes applicables à une grande variété de types de cellules. Biotechnologie. Bioeng. 83, 173 – 180 (2003).

Article  CAS  Google Scholar 

Zheng, H. et al. La culture rotative favorise la prolifération de cellules MCF-7 encapsulées dans des hydrogels tridimensionnels de collagène et d'alginate via l'activation de la voie ERK1/2-MAPK. Bioméde. Maître. 7, 015003 (2012).

Article  Google Scholar 

Raghavan, S. et coll. Analyse comparative des techniques de génération de sphéroïdes tumoraux pour la toxicité différentielle des médicaments in vitro. Oncotarget 7, 16948 – 16961 (2016).

Article  Google Scholar 

Marchi, F. & Leblond, CP Biogenèse du collagène et assemblage en fibrilles comme le montrent les études radioautographiques ultrastructurales et 3H-proline sur les fibroblastes de la plaque alimentaire du rat. Suis. J. Anat. 168, 167 – 197 (1983).

Article  CAS  Google Scholar 

McCaffrey, G. et coll. Les jonctions serrées contiennent un assemblage de protéines oligomères essentiels au maintien de l'intégrité de la barrière hémato-encéphalique in vivo. J. Neurochem. 103, 2540 – 2555 (2007).

CAS  Google Scholar 

Seger, D., Seger, R. & Shaltiel, S. La phosphorylation CK2 de la vitronectine. Promotion de l'adhésion cellulaire via l'α_vβ₃-voie de la phosphatidylinositol 3-kinase. J. Biol. Chem. 276, 16998 – 17006 (2001).

Article  CAS  Google Scholar 

Weber, GF et coll. L'interaction de l'ostéopontine dépendante de la phosphorylation avec ses récepteurs régule la migration et l'activation des macrophages. J. Leukoc. Biol. 72, 752 – 761 (2002).

Article  CAS  Google Scholar 

Yalak, G. & Vogel, V. Phosphorylation extracellulaire et protéines phosphorylées : pas seulement des curiosités mais physiologiquement importantes. Sci. Signal. 5, re7 (2012).

Article  Google Scholar 

Wu, D. et coll. Polymères à assemblage et rigidité contrôlés fabriqués à partir de faisceaux peptidiques fonctionnels par clic. Nature 574, 658 – 662 (2019).

Article  CAS  Google Scholar 

Du, X., Zhou, J., Shi, J. & Xu, B. Hydrogélateurs et hydrogels supramoléculaires : de la matière molle aux biomatériaux moléculaires. Chem. Tour. 115, 13165 – 13307 (2015).

Article  CAS  Google Scholar 

Cheetham, AG, Zhang, P., Lin, YA, Lock, LL & Cui, H. Nanostructures supramoléculaires formées par l'assemblage de médicaments anticancéreux. Confiture. Chem. Soc. 135, 2907 – 2910 (2013).

Article  CAS  Google Scholar 

Tibbitt, MW & Anseth, KS Hydrogels comme imitation de matrice extracellulaire pour la culture cellulaire 3D. Biotechnologie. Bioeng. 103, 655 – 663 (2009).

Article  CAS  Google Scholar 

Jayawarna, V. et al. Hydrogels nanostructurés pour la culture cellulaire tridimensionnelle par auto-assemblage de fluorénylméthoxycarbonyl-dipeptides. Av. Mater. 18, 611 – 614 (2006).

Article  CAS  Google Scholar 

Smith, DJ et coll. Un hydrogel peptidique de transition multiphasé pour suturer des vaisseaux ultrapetits. Nat. Nanotechnologie. 11, 95 – 102 (2016).

Article  CAS  Google Scholar 

Alvarez, Z. et coll. Les échafaudages bioactifs dotés d’un mouvement supramoléculaire amélioré favorisent la récupération après une lésion de la moelle épinière. Sciences 374, 848 – 856 (2021).

Article  CAS  Google Scholar 

Winkler, SM, Harrison, MR & Messersmith, PB Biomatériaux en chirurgie fœtale. Biomère. Sci. 7, 3092 – 3109 (2019).

Article  CAS  Google Scholar 

Wang, H., Feng, Z. et Xu, B. L'assemblage intercellulaire instruit imite la dynamique des protéines pour induire des sphéroïdes cellulaires. Confiture. Chem. Soc. 141, 7271 – 7274 (2019).

Article  CAS  Google Scholar 

Wang, H. et al. Un continuum dynamique in situ de phosphoglycopeptides supramoléculaires permet la formation de sphéroïdes cellulaires 3D. Angew. Chem. Int. Éd. 56, 16297 – 16301 (2017).

Article  CAS  Google Scholar 

Lui, H. et al. Synthèse enzymatique non covalente. Chem. Tour. 120, 9994 – 10078 (2020).

Article  CAS  Google Scholar 

Zhang, Y., Kuang, Y., Gao, Y. et Xu, B. Motifs polyvalents de petites molécules pour l'auto-assemblage dans l'eau et la formation d'hydrogels supramoléculaires biofonctionnels. Langmuir 27, 529 – 537 (2011).

Article  CAS  Google Scholar 

Reches, M. & Gazit, E. Coulée de nanofils métalliques dans des nanotubes peptidiques discrets auto-assemblés. Sciences 300, 625 – 627 (2003).

Article  Google Scholar 

Gao, Y., Shi, J., Yuan, D. et Xu, B. Imagerie de l'auto-assemblage déclenché par des enzymes de petites molécules à l'intérieur de cellules vivantes. Nat. Commun. 3, 1033 (2012).

Article  Google Scholar 

Van Itallie, CM & Anderson, JM L'occludine confère une adhésivité lorsqu'elle est exprimée dans les fibroblastes. J. Cell Sci. 110, 1113 – 1121 (1997).

Article  Google Scholar 

Mmeny, RJ et coll. Un domaine clé de la boucle extracellulaire de claudine est essentiel à l’intégrité de la barrière épithéliale. Un m. J. Pathol. 172, 905 – 915 (2008).

Article  CAS  Google Scholar 

Lee, M., Ghosh, U., Thurber, KR, Kato, M. & Tycko, R. Structure moléculaire et interactions au sein de fibrilles de type amyloïde formées par une séquence protéique de faible complexité issue du FUS. Nat. Commun. 11, 5735 (2020).

Article  Google Scholar 

Roder, C. et coll. Structure atomique des fibrilles amyloïdes PI3-kinase SH3 par cryomicroscopie électronique. Nat. Commun. 10, 3754 (2019).

Article  Google Scholar 

Cao, Q., Boyer, DR, Sawaya, MR, Ge, P. & Eisenberg, DS Structures Cryo-EM de quatre noyaux amyloïdes polymorphes TDP-43. Nat. Structurer. Mol. Biol. 26, 619 – 627 (2019).

Article  CAS  Google Scholar 

Fitzpatrick, AWP et coll. Structures cryo-EM de filaments tau issus de la maladie d'Alzheimer. Nature 547, 185 – 190 (2017).

Article  CAS  Google Scholar 

Falcon, B. et coll. Le nouveau pli du filament tau dans l'encéphalopathie traumatique chronique renferme des molécules hydrophobes. Nature 568, 420 – 423 (2019).

Article  CAS  Google Scholar 

Wang, F. et coll. Chaos déterministe dans l'auto-assemblage de nanotubes en feuillet β à partir d'un oligopeptide amphipathique. Matière 4, 3217 – 3231 (2021).

To, WS & Midwood, KS Plasma et fibronectine cellulaire : fonctions distinctes et indépendantes lors de la réparation tissulaire. Réparation des tissus par fibrogenèse 4, 21 (2011).

Article  CAS  Google Scholar 

Lu, Y. et al. La vacuoline-1 inhibe puissamment et de manière réversible la fusion autophagosome-lysosome en activant RAB5A. Autophagie 10, 1895 – 1905 (2014).

Article  Google Scholar 

Du, X. et coll. Généré in situ d‐des nanofibrilles peptidiques comme inducteurs apoptotiques à multiples facettes pour cibler les cellules cancéreuses. Cell Death Dis. 8, e2614 à e2614 (2017).

Article  CAS  Google Scholar 

Feng, Z., Wang, H., Chen, X. et Xu, B. La capacité d'auto-assemblage détermine l'activité d'auto-assemblage commandé par une enzyme pour inhiber les cellules cancéreuses. Confiture. Chem. Soc. 139, 15377 – 15384 (2017).

Article  CAS  Google Scholar 

Shigemitsu, H. et al. Un hydrogel supramoléculaire adaptatif comprenant des réseaux de doubles nanofibres auto-triés. Nat. Nanotechnologie. 13, 165 – 172 (2018).

Article  CAS  Google Scholar 

Epstein, IR & Xu, B. Processus de réaction-diffusion aux échelles nano et micro. Nat. Nanotechnologie. 11, 312 – 319 (2016).

Article  CAS  Google Scholar 

Liang, G., Ren, H. et Rao, J. Une réaction de condensation biocompatible pour l'assemblage contrôlé de nanostructures dans des cellules vivantes. Nat. Chim. 2, 54 – 60 (2010).

Article  CAS  Google Scholar 

Engler, AJ, Sen, S., Sweeney, HL et Discher, DE L'élasticité de la matrice dirige la spécification de la lignée des cellules souches. Cellule 126, 677 – 689 (2006).

Article  CAS  Google Scholar 

Ottinger, EA, Shekels, LL, Bernlohr, DA & Barany, G. Synthèse de peptides contenant de la phosphotyrosine et leur utilisation comme substrats pour les protéines tyrosine phosphatases. Biochimie 32, 4354 – 4361 (1993).

Article  CAS  Google Scholar 

Liu, S. et coll. Formation enzymatique d'assemblages peptidiques intranucléaires pour tuer sélectivement les cellules souches pluripotentes induites par l'homme. Confiture. Chem. Soc. 143, 15852 – 15862 (2021).

Article  CAS  Google Scholar 

Basu Ray, G., Chakraborty, I. & Moulik, SP L'absorption du pyrène peut être une méthode pratique pour sonder la concentration micellaire critique (cmc) et indexer la polarité micellaire. J. Interface colloïdale Sci. 294, 248 – 254 (2006).

Article  CAS  Google Scholar 

Rohou, A. & Grigorieff, N. CTFFIND4 : estimation rapide et précise de la défocalisation à partir de micrographies électroniques. J. Structure. Biol. 192, 216 – 221 (2015).

Article  Google Scholar 

Zheng, SQ et al. MotionCor2 : correction anisotrope du mouvement induit par le faisceau pour une cryomicroscopie électronique améliorée. Nat. Les méthodes 14, 331 – 332 (2017).

Article  CAS  Google Scholar 

Punjani, A., Zhang, H. & Fleet, DJ Raffinement non uniforme : la régularisation adaptative améliore la reconstruction cryo-EM à une seule particule. Nat. Les méthodes 17, 1214 – 1221 (2020).

Article  CAS  Google Scholar 

Emsley, P. & Cowtan, K. Coot : outils de création de modèles pour les graphiques moléculaires. Acta Crystallogr. ré 60, 2126 – 2132 (2004).

Article  Google Scholar 

Afonine, PV et al. Affinement de l'espace réel dans PHENIX pour la cryo-EM et la cristallographie. Acta Crystallogr. ré 74, 531 – 544 (2018).

Article  CAS  Google Scholar