Una plataforma fácil de usar es una puerta de entrada a la IA en microscopía

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Ejemplo que ilustra cómo la IA a través de ZeroCostDL4Mic se puede utilizar para detectar el núcleo de las células cancerosas a partir de imágenes microscópicas. Imagen superior: imagen microscópica original. Imagen inferior: imagen en la que cada célula cancerosa detectada tiene un color diferente. Fotos: Guillaume Jacquemet.

Abstracto:
El software que utiliza inteligencia artificial, IA, está revolucionando la forma en que se analizan las imágenes microscópicas. Por ejemplo, la IA se puede utilizar para detectar características en imágenes (es decir, tumores en muestras de biopsia) o mejorar la calidad de las imágenes eliminando el ruido no deseado. Sin embargo, los no expertos continúan encontrando las tecnologías de IA difíciles de usar.

Una plataforma fácil de usar es una puerta de entrada a la IA en microscopía

Turku, Finlandia | Publicado el 23 de abril de 2021

En el artículo "Democratizando el aprendizaje profundo para microscopía con ZeroCostDL4Mic", publicado en Nature Communications el 15 de abril de 2021, los investigadores describen una plataforma llamada ZeroCostDL4Mic, que hace que estas tecnologías de IA sean accesibles para todos.

“La novedad clave es que ZeroCostDL4Mic se ejecuta en la nube de forma gratuita y no requiere que los usuarios tengan experiencia en codificación o habilidades computacionales avanzadas. Efectivamente, se ejecuta en cualquier computadora que tenga un navegador web ”, dice Guillaume Jacquemet, investigador principal en biología celular en la Universidad Åbo Akademi.

Durante los últimos 400 años, los microscopios han permitido a la humanidad observar objetos que de otro modo serían demasiado pequeños para ser vistos a simple vista. Hoy en día, la microscopía es una tecnología líder utilizada en todo el mundo para realizar no solo investigación sino también diagnósticos.

Los microscopios modernos están conectados directamente a cámaras digitales, lo que lleva a la adquisición de cientos a miles de imágenes por muestra. Estas imágenes deben procesarse en una computadora para obtener datos significativos, lo cual es una tarea enorme.

Para ayudar con la cantidad de imágenes, Jacquemet y sus colegas han utilizado IA para entrenar una máquina para que haga el trabajo. En la práctica, ZeroCostDL4Mic es una colección de cuadernos autoexplicativos para Google Colab, con una interfaz gráfica de usuario fácil de usar.

“Creemos que ZeroCostDL4Mic actuará como 'una droga de entrada' para la IA, atrayendo a los usuarios a explorar estas nuevas tecnologías que transformarán la investigación y el diagnóstico biomédicos en las próximas décadas”, dice Jacquemet.

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El desarrollo de la plataforma ZeroCostDL4Mic fue coordinado por los laboratorios de Guillaume Jacquemet (Universidad Åbo Akademi, Turku, Finlandia) y Ricardo Henriques (Instituto Gulbenkian de Ciência, Oeiras, Portugal). Se trata de un gran consorcio internacional que abarca 12 laboratorios, repartidos en nueve países y dos continentes.

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Contactos:
Guillermo Jacquemet
+358 (503) 235-606

@aboakademi

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