Uma plataforma fácil de usar é uma porta de entrada para IA em microscopia

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Exemplo que ilustra como AI via ZeroCostDL4Mic pode ser usado para detectar o núcleo de células cancerosas a partir de imagens de microscopia. Imagem superior: imagem microscópica original. Imagem inferior: Imagem em que cada célula cancerosa detectada tem uma cor diferente. Fotos: Guillaume Jacquemet.
Exemplo que ilustra como AI via ZeroCostDL4Mic pode ser usado para detectar o núcleo de células cancerosas a partir de imagens de microscopia. Imagem superior: imagem microscópica original. Imagem inferior: Imagem em que cada célula cancerosa detectada tem uma cor diferente. Fotos: Guillaume Jacquemet.

Abstrato:
O software que usa inteligência artificial, IA, está revolucionando a forma como as imagens de microscopia são analisadas. Por exemplo, a IA pode ser usada para detectar características em imagens (ou seja, tumores em amostras de biópsia) ou melhorar a qualidade das imagens removendo ruídos indesejados. No entanto, os não especialistas continuam achando as tecnologias de IA difíceis de usar.

Uma plataforma fácil de usar é uma porta de entrada para IA em microscopia


Turku, Finlândia | Postado em 23 de abril de 2021

No artigo “Democratizando o aprendizado profundo para microscopia com ZeroCostDL4Mic”, publicado na Nature Communications em 15 de abril de 2021, os pesquisadores descrevem uma plataforma chamada ZeroCostDL4Mic, que torna essas tecnologias de IA acessíveis a todos.

“A principal novidade é que ZeroCostDL4Mic roda na nuvem gratuitamente e não exige que os usuários tenham qualquer experiência de codificação ou habilidades computacionais avançadas. Efetivamente, ele roda em qualquer computador que tenha um navegador da web ”, diz Guillaume Jacquemet, Pesquisador Sênior em Biologia Celular da Universidade Åbo Akademi.

Nos últimos 400 anos, os microscópios permitiram que a humanidade observasse objetos que, de outra forma, seriam pequenos demais para serem vistos a olho nu. Hoje, a microscopia é uma tecnologia líder usada em todo o mundo para realizar não apenas pesquisas, mas também diagnósticos.

Microscópios modernos são conectados diretamente a câmeras digitais, levando à aquisição de centenas a milhares de imagens por amostra. Essas imagens precisam ser processadas em um computador para obter dados significativos, o que é um grande empreendimento.

Para ajudar com o número de imagens, Jacquemet e seus colegas usaram a IA para treinar uma máquina para fazer o trabalho. Na prática, ZeroCostDL4Mic é uma coleção de cadernos autoexplicativos para o Google Colab, apresentando uma interface gráfica de usuário fácil de usar.

“Acreditamos que ZeroCostDL4Mic atuará como uma 'porta de entrada' para IA, atraindo os usuários a explorar essas novas tecnologias que transformarão a pesquisa biomédica e o diagnóstico nas próximas décadas”, diz Jacquemet.

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O desenvolvimento da plataforma ZeroCostDL4Mic foi coordenado pelos laboratórios de Guillaume Jacquemet (Åbo Akademi University, Turku, Finlândia) e Ricardo Henriques (Instituto Gulbenkian de Ciência, Oeiras, Portugal). Envolveu um grande consórcio internacional envolvendo 12 laboratórios, espalhados por nove países e dois continentes.

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Contactos:
Guilherme Jacquemet
358-503-235-606

@aboakademi

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