הסקת פעילות לא-שיווי משקל תלויה בקנה מידה באמצעות ננו-צינורות פחמן

Needleman, D. & Dogic, Z. חומר פעיל בממשק בין מדעי החומרים וביולוגיה של התא. נאט. הכמרית מטר. 2, 17048 (2017).

סעיף  CAS  Google Scholar 

Ramaswamy, S. המכניקה והסטטיסטיקה של חומר פעיל. אננו. הכומר מעבה. חומר פיזי. 1, 323-345 (2010).

סעיף  Google Scholar 

Marchetti, M. et al. הידרודינמיקה של חומר פעיל רך. הכמרית מוד. פיז. 85, 1143-1189 (2013).

סעיף  CAS  Google Scholar 

Bowick, M., Fakhri, N., Marchetti, M. & Ramaswamy, S. סימטריה, תרמודינמיקה וטופולוגיה בחומר פעיל. פיז. הכומר X 12, 010501 (2022).

CAS  Google Scholar 

Yang, X. et al. ביו-אנרגטיה פיזית: שטפי אנרגיה, תקציבים ומגבלות בתאים. מעבד נט"ל אכד. Sci. ארה"ב 118, e2026786118 (2021).

סעיף  CAS  Google Scholar 

טאן, ת' ועוד. דפוסי מתח מאורגנים עצמיים מניעים מעברי מצב בקליפת האקטין. מדע. עו"ד 4, ear2847 (2018).

סעיף  Google Scholar 

Gladrow, J., Fakhri, N., MacKintosh, F. C., Schmidt, C. F. & Broedersz, C. P. איזון מפורט שבור של דינמיקה של חוטים ברשתות פעילות. פיז. הכומר לט. 116, 248301 (2016).

סעיף  CAS  Google Scholar 

Landau, L., Lifshitz, E., Sykes, J., & Reid, W. תורת האלסטיות (אדיסון-וסלי 1959).

Brangwynne, C. P., Koenderink, G. H., MacKintosh, F. C. & Weitz, D. A. Nonequilibrium microtubule fluktuations in cytoskeleton model. פיז. הכומר לט. 100, 118104 (2008).

סעיף  Google Scholar 

אנגליה, J.L. הסתגלות מתפזרת בהרכבה עצמית מונעת. נאט. ננוטכנול. 10, 919-923 (2015).

סעיף  CAS  Google Scholar 

Mizuno, D., Tardin, C., Schmidt, C. F. & MacKintosh, F. C. מכניקה ללא שיווי משקל של רשתות ציטו-שלד פעילות. מדע 315, 370-373 (2007).

סעיף  CAS  Google Scholar 

קרב, ג' ואח'. איזון מפורט שבור בקנה מידה מזוסקופי במערכות ביולוגיות פעילות. מדע 352, 604-607 (2016).

סעיף  CAS  Google Scholar 

Egolf, D.A. שיווי המשקל חזר: מכאוס ללא שיווי משקל למכניקה סטטיסטית. מדע 287, 101-104 (2000).

סעיף  CAS  Google Scholar 

Prost, J., Jülicher, F. & Joanny, J-F. פיזיקת ג'ל פעילה. נאט. פיז. 11, 111-117 (2015).

סעיף  CAS  Google Scholar 

O'Byrne, J., Kafri, Y., Tailleur, J. & van Wijland, F. זמן בלתי הפיך בחומר פעיל, ממיקרו למקרו. נט. הכומר פיס. 4, 167-183 (2022).

סעיף  Google Scholar 

Gnesotto, F. S., Mura, F., Gladrow, J. & Broedersz, C. P. איזון מפורט שבור ודינמיקה של אי-שיווי משקל במערכות חיים: סקירה. נציג פרוג. פיז. 81, 066601 (2018).

סעיף  CAS  Google Scholar 

פח'רי, נ' ועוד. מיפוי ברזולוציה גבוהה של תנודות תוך תאיות באמצעות ננו-צינוריות פחמן. מדע 344, 1031-1035 (2014).

סעיף  CAS  Google Scholar 

Fakhri, N., Tsyboulski, D. A., Cognet, L., Weisman, R. B. & Pasquali, M. דינמיקת כיפוף תלוית קוטר של ננו-צינוריות פחמן חד-דופן בנוזלים. מעבד נט"ל אכד. Sci. ארה"ב 106, 14219-14223 (2009).

סעיף  CAS  Google Scholar 

Fakhri, N., MacKintosh, F. C., Lounis, B., Cognet, L. & Pasquali, M. תנועה בראונית של חוטים נוקשים בסביבה צפופה. מדע 330, 1804-1807 (2010).

סעיף  CAS  Google Scholar 

Murrell, M. P. & Gardel, M. L. F-actin buckling מתאם התכווצות וניתוק בקליפת אקטומיוזין ביומימטית. מעבד נט"ל אכד. Sci. ארה"ב 109, 20820-20825 (2012).

סעיף  CAS  Google Scholar 

Weiss, J.B. אינווריאנטיות קואורדינטות במערכות דינמיות סטוכסטיות. טלוס א 55, 208-218 (2003).

סעיף  Google Scholar 

Crooks, G.E. משפט תנודת ייצור אנטרופיה ויחס העבודה ללא שיווי משקל להפרשי אנרגיה חופשית. פיז. הכמרית ה 60, 2721-2726 (1999).

סעיף  CAS  Google Scholar 

Ro, S. et al. מדידה ללא מודל של ייצור אנטרופיה מקומית ועבודה ניתנת לחילוץ בחומר פעיל. פיז. הכומר לט. 129, 220601 (2022).

סעיף  CAS  Google Scholar 

Harunari, P. E., Dutta, A., Polettini, M. & Roldán, É. What to learn from a few visible transitions’ statistics? פיז. הכומר X 12, 041026 (2022).

CAS  Google Scholar 

van der Meer, J., Ertel, B. & Seifert, U. הסקה תרמודינמית ברשתות מרקוב נגישות חלקית: פרספקטיבה מאחדת מהתפלגות זמן המתנה מבוססות מעבר. הדפסה מוקדמת ב https://arxiv.org/abs/2203.07427 (2022).

van der Meer, J., Degünther, J. & Seifert, U. נתונים סטטיסטיים שנפתרו בזמן של קטעים כמסגרת כללית לאומדי אנטרופיה ללא מודל. הדפסה מוקדמת ב https://arxiv.org/abs/2211.17032 (2022).

Roldán, E., Barral, J., Martin, P., Parrondo, J. M. R. & Jülicher, F. כימות ייצור אנטרופיה בתנודות אקטיביות של צרור תאי השיער מיחסי אי-הפיך בזמן ואי-ודאות. ג'יי פיס חדש. 23, 083013 (2021).

סעיף  Google Scholar 

Tucci, G. et al. דוגמנות תנודות אקטיביות שאינן מרקוביאניות. פיז. הכומר לט. 129, 030603 (2022).

סעיף  CAS  Google Scholar 

Skinner, D. J. & Dunkel, J. גבולות משופרים לייצור אנטרופיה במערכות חיות. מעבד נט"ל אכד. Sci. ארה"ב 118, e2024300118 (2021).

סעיף  CAS  Google Scholar 

Weiss, J. B., Fox-Kemper, B., Mandal, D., Nelson, A. D. & Zia, R. K. P. תנודות ללא שיווי משקל, תנע זוויתי הסתברות ומערכת האקלים. J. Stat. פיזי. 179, 1010-1027 (2020).

סעיף  Google Scholar 

Gonzalez, J. P., Neu, J. C. & Teitsworth, S. W. מדדים ניסויים לזיהוי הפרת איזון מפורטת. פיז. הכמרית ה 99, 022143 (2019).

סעיף  CAS  Google Scholar 

Zia, R. K. P., Weiss, J. B., Mandal, D. & Fox-Kemper, B. התנהגות מחזורית מובהקת ועדינה במצבים יציבים ללא שיווי משקל. ג'יי פיס. קונפ. סר. 750, 012003 (2016).

סעיף  Google Scholar 

Li, J., Horowitz, J. M., Gingrich, T. R. & Fakhri, N. כימות פיזור באמצעות זרמים משתנים. נאט. קומון. 10, 1666 (2019).

סעיף  Google Scholar 

Guo, M. et al. בדיקה של התכונות הסטוכסטיות, המונעות המוטוריות של הציטופלזמה באמצעות מיקרוסקופ ספקטרום כוח. תא 158, 822-832 (2014).

סעיף  CAS  Google Scholar 

MacKintosh, F. C. & Levine, A. J. Nonequilibrium מכניקה ודינמיקה של ג'לים המופעלים על ידי מנוע. פיז. הכומר לט. 100, 018104 (2008).

סעיף  CAS  Google Scholar 

מאליק-גרבי, מ' ואח'. התנהגות קנה מידה ברשתות אקטומיוזין מתכווצות במצב יציב. נאט. פיז. 15, 509-516 (2019).

סעיף  CAS  Google Scholar 

MacKintosh, F. C., Käs, J. & Janmey, P. A. גמישות של רשתות ביו-פולימר גמישות למחצה. פיז. הכומר לט. 75, 4425-4428 (1995).

סעיף  CAS  Google Scholar 

Valentine, M. T., Perlman, Z. E., Mitchison, T. J. & Weitz, D. A. מאפיינים מכניים של קסנופוס תמציות ציטופלזמה של ביצה. ביופיס. J. 88, 680-689 (2005).

סעיף  CAS  Google Scholar 

Field, C. M., Pelletier, J. F. & Mitchison, T. J. in שיטות בביולוגיה של התא: ציטוקינזיס כרך א. 137 (עורך Echard, A.) 395–435 (אקדמי, 2017).

Riedl, J. et al. Lifeact: סמן רב תכליתי להמחשת F-actin. Nat. שיטות 5, 605-607 (2008).

סעיף  CAS  Google Scholar 

Chen, D. T., Heymann, M., Fraden, S., Nicastro, D. & Dogic, Z. צריכת ATP של דגלים אוקריוטיים נמדדה ברמת תא בודד. ביופיס. J. 109, 2562-2573 (2015).

סעיף  CAS  Google Scholar 

Ruhnow, F., Zwicker, D. & Diez, S. מעקב אחר חלקיקים בודדים וחוטים מוארכים בדיוק ננומטרי. ביופיס. J. 100, 2820-2828 (2011).

סעיף  CAS  Google Scholar