Kasvufaktori sekretsioonide ja üksikute rakkude transkriptoomide seostamine nanoviaalides, kasutades SEC-seq - Nature Nanotechnology

Uhlén, M. et al. Inimese proteoomi koepõhine kaart. teadus 347, 1260419 – 1260419 (2015).

Artikkel 

Google Scholar 

Miwa, H., Dimatteo, R., de Rutte, J., Ghosh, R. & Di Carlo, D. Single-cell sorting põhineb sekreteeritud toodetel funktsionaalselt määratletud rakuteraapia jaoks. Microsystem. Nanoeng. 8, 84 (2022).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Levy, O. et al. Lõhkuvad tõkked kliiniliselt oluliste MSC-teraapiate suunas. Sci. Adv. 6, eaba6884 (2020).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Kode, JA, Mukherjee, S., Joglekar, MV & Hardikar, AA Mesenhümaalsed tüvirakud: immunobioloogia ja roll immunomodulatsioonis ja kudede regenereerimises. Tsütoteraapia 11, 377 – 391 (2009).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Bode, D., Cull, AH, Rubio-Lara, JA & Kent, DG. Üherakuliste tööriistade kasutamine geeni- ja rakuteraapias. Ees. Immunol. 12, 2775 (2021).

Artikkel 

Google Scholar 

Lee, S., De Rutte, J., Dimatteo, R., Koo, D. & Di Carlo, D. Biomolekulidega ruumiliselt funktsionaliseeritud 3D-struktureeritud mikroosakeste skaleeritav valmistamine ja kasutamine. ACS Nano 16, 38 – 49 (2022).

CAS 

Google Scholar 

De Rutte, J. et al. Riputavad hüdrogeeli nanoviaalid massiliselt paralleelseks üherakuliseks funktsionaalseks analüüsiks ja sorteerimiseks. ACS Nano 16, 7242 – 7257 (2022).

Google Scholar 

de Rutte, J., Dimatteo, R., Zhu, S., Archang, MM & Di Carlo, D. Üherakuliste mikrokandjate sorteerimine kaubanduslike voolutsütomeetrite abil. SLAS Technol. 27, 150 – 159 (2022).

Artikkel 

Google Scholar 

Stoeckius, M. et al. Samaaegne epitoobi ja transkriptoomi mõõtmine üksikutes rakkudes. Nat. Meetodid 14, 865 – 868 (2017).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Peterson, VM jt. Valkude ja transkriptide mitmekordne kvantifitseerimine üksikutes rakkudes. Nat. Biotehnoloogia. 35, 936 – 939 (2017).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Thej, C., Ramadasse, B., Walvekar, A., Majumdar, AS & Balasubramanian, S. Surrogaat-potentsianalüüsi väljatöötamine Stempeucel®, ühendatud, ex-vivo laiendatud allogeense inimese luuüdi angiogeense aktiivsuse määramiseks mesenhümaalne stroomarakkude toode. Tüvirakk. Res. Seal. 8, 1 – 14 (2017).

Artikkel 

Google Scholar 

Berry, JD et al. NurOwn, 2. faas, randomiseeritud, kliiniline uuring ALS-iga patsientidel. Neuroloogia 93, e2294–e2305 (2019).

Artikkel 

Google Scholar 

Yousefi, K. et al. 2b. faasi, randomiseeritud, topeltpime ja platseebokontrolliga uuringu ülesehitus ja põhjendus, et hinnata lomecel-B ohutust ja efektiivsust nõrkadel vanematel täiskasvanutel. J. Nõrkus Vananemine 11, 214 – 223 (2022).

CAS 

Google Scholar 

Mereu, E. et al. Rakkude atlase projektide üherakuliste RNA sekveneerimisprotokollide võrdlusuuringud. Nat. Biotehnoloogia. 38, 747 – 755 (2020).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Koch, F. et al. Üldine meetod printimisakna reguleerimiseks ekstrusioonil põhineva 3D-bioprintimise jaoks, et säilitada mesenhümaalsete tüvirakkude kõrge elujõulisus alginaat-želatiinhüdrogeelis. Biotrükk 20, e00094 (2020).

Artikkel 

Google Scholar 

Schwartz, MA & Assoian, RK Integriinid ja tsükliinist sõltuvate kinaaside rakkude proliferatsiooni reguleerimine tsütoplasmaatiliste signaaliradade kaudu. J. Cell Sci. 114, 2553 – 2560 (2001).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Potier, E. et al. Hüpoksia mõjutab mesenhümaalsete stroomarakkude osteogeenset diferentseerumist ja angiogeense faktori ekspressiooni. luu 40, 1078 – 1087 (2007).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Liu, G.-S. et al. Rasvast pärinevate tüvirakkude farmakoloogiline praimimine parakriinse VEGF-i tootmiseks deferoksamiiniga. J. Tissue Eng. Regen. Med. 10, E167–E176 (2016).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Waters, JA, Urbano, I., Robinson, M. & House, CD Insuliinilaadset kasvufaktorit siduv valk 5: erinevad rollid vähis. Ees. Oncol. 12, 1052457 (2022).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Sureshbabu, A. et al. IGFBP5 indutseerib rakkude adhesiooni, suurendab rakkude ellujäämist ja pärsib rakkude migratsiooni MCF-7 inimese rinnavähirakkudes. J. Cell Sci. 125, 1693 – 1705 (2012).

CAS 

Google Scholar 

Al Halawani, A., Abdulkhalek, L., Mithieux, SM & Weiss, AS Tropoelastin soodustab tihedate, omavahel seotud endoteelivõrkude moodustumist. Biomolekulid 11, 1318 (2021).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Zheng, H., Fu, G., Dai, T. & Huang, H. Endoteeli eellasrakkude migratsioon, mida vahendab stroomarakkudest saadud faktor-1alpha/CXCR4 PI3K/Akt/eNOS signaaliülekande raja kaudu. J. Cardiovasc. Pharmacol. 50, 274 – 280 (2007).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Chou, CH et al. SCUBE3 varajase kopsuvähi angiogeneesi ja metastaatilise progresseerumise reguleerimine. Clin. Exp. metastaas 30, 741 – 752 (2013).

CAS 

Google Scholar 

Fan, D. & Kassiri, Z. Metalloproteinaasi 3 (TIMP3) koe inhibiitori bioloogia ja selle terapeutiline mõju kardiovaskulaarsele patoloogiale. Esiosa. Physiol. 11, 661 (2020).

Artikkel 

Google Scholar 

Poss, KD & Tonegawa, S. Heme oksügenaas 1 on vajalik imetajate raua taaskasutamiseks. Proc. Natl Acad. Sci. USA 94, 10919 (1997).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Lenselink, EA Fibronektiini roll normaalses haavade paranemises. Int. Haav J. 12, 313 (2015).

Artikkel 

Google Scholar 

DiFeo, A., Martignetti, JA & Narla, G. KLF6 ja selle splaissivariantide roll vähiravis. Narkootikumide vastupanu. Värskenda. 12, 1 – 7 (2009).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Higuchi, M. et al. PRRX1- ja PRRX2-positiivsed mesenhümaalsed tüvirakud / eellasrakud osalevad vaskulogeneesis roti embrüonaalse hüpofüüsi arengu ajal. Cell Tissue Res. 361, 557 – 565 (2015).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Dong, Y. et al. RBPjkappa-sõltuv Notch-signalisatsioon reguleerib mesenhümaalsete eellasrakkude proliferatsiooni ja diferentseerumist skeleti arengu ajal. & Tarkvaraarendus 137, 1461 – 1471 (2010).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Han, H. et al. TRRUST v2: laiendatud viiteandmebaas inimese ja hiire transkriptsiooni reguleerivate interaktsioonide kohta. Nucleic Acids Res. 46, D380–D386 (2018).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Cheng, RY-H. et al. SEC-seq: molekulaarsete signatuuride seos antikeha sekretsiooniga tuhandetes üksikutes inimese plasmarakkudes. Nat. Kommuun. 14, 3567 (2023).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Shum, EY, Walczak, EM, Chang, C. & Christina Fan, H. mRNA transkriptide ja valkude kvantifitseerimine BD Rhapsody abil^TM üherakuline analüüsisüsteem. Adv. Exp. Med. Biol. 1129, 63 – 79 (2019).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Trzupek, D. et al. CD80 ja CD86 kui regulatiivsete T-rakkude hiljutiste aktivatsioonimarkerite avastamine valgu-RNA üherakulise analüüsi abil. Genome Med. 12, 55 (2020).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Vanuytsel, K. et al. Inimese loote maksa hematopoeetiliste tüvirakkude multimodaalne profiilide koostamine näitab siirdamise molekulaarset allkirja. Nat. Kommuun. 13, 1103 (2022).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Wu, T. et al. Üherakulise valgu sekretsiooni ajaliselt lahendatud hindamine sekveneerimise teel. Nat. Meetodid 20, 723 – 734 (2023).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Xie, Z. et al. Inimese luuüdist pärinevate mesenhümaalsete tüvirakkude üherakuline RNA sekveneerimise analüüs ja funktsionaalne alampopulatsiooni tuvastamine. Exp. Mol. Med. 54, 483 – 492 (2022).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Sun, C. et al. Üherakuline RNA-seq tõstab esile heterogeensuse inimese primaarsetes Whartoni tarretises mesenhümaalsetes tüvi- / stroomarakkudes, mida kultiveeritakse in vitro. Stem Cell Res. Seal. 11, 149 (2020).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Zhang, C. et al. Üherakuline transkriptoomiline analüüs näitab mesenhümaalsete tüvirakkude rakulist heterogeensust. Genoomika Proteom. Bioinform. 20, 70 – 86 (2022).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Cui, Y. et al. Suurenenud diferentseerumisvõimega ühekihiliste kultiveeritud inimese hambapulbi tüvirakkude üherakuline iseloomustus. Int. J. Oral. Sci. 13, 44 (2021).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Vistain, L. et al. Ekstratsellulaarsete valkude, valgukomplekside ja mRNA-de kvantifitseerimine üksikutes rakkudes lähedusjärjestuse abil. Nat. Meetodid 19, 1578 – 1589 (2022).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Baloh, RH et al. GDNF-i sekreteerivate inimese neuraalsete eellasrakkude siirdamine ALS-iga patsientide seljaajusse: faasi 1/2a uuring. Nat. Med. 28, 1813 – 1822 (2022).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Carraro, G. et al. Tsüstilise fibroosi hingamisteede transkriptsioonianalüüs üherakulise eraldusvõimega näitab muutunud epiteelirakkude olekut ja koostist. Nat. Med. 27, 806 – 814 (2021).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Chen, G. et al. Inimese sekretoomi põhjalik tuvastamine ja iseloomustamine integratiivsete proteoomiliste ja transkriptoomiliste andmete põhjal. Ees. Cell Dev. Biol. 7, 299 (2019).

Artikkel 

Google Scholar 

Hu, H. et al. AnimalTFDB 3.0: põhjalik ressurss loomade transkriptsioonifaktorite märkimiseks ja ennustamiseks. Nucleic Acids Res. 47, D33–D38 (2019).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar 

Bausch-Fluck, D. et al. In silico inimese pind. Proc. Natl Acad. Sci. USA 115, E10988–E10997 (2018).

Artikkel 
CAS 

Google Scholar