Udledning af skalaafhængig ikke-ligevægtsaktivitet ved hjælp af kulstofnanorør

Udledning af skalaafhængig ikke-ligevægtsaktivitet ved hjælp af kulstofnanorør

Kildeknude: 2639824
  • Needleman, D. & Dogic, Z. Aktivt stof i grænsefladen mellem materialevidenskab og cellebiologi. Nat. Rev. Mater. 2, 17048 (2017).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Ramaswamy, S. Mekanikken og statistikken for aktivt stof. Annu. Rev. kondenserer. Matter Phys. 1, 323-345 (2010).

    Artikel  Google Scholar 

  • Marchetti, M. et al. Hydrodynamik af blødt aktivt stof. Rev. Mod. Phys. 85, 1143-1189 (2013).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Bowick, M., Fakhri, N., Marchetti, M. & Ramaswamy, S. Symmetri, termodynamik og topologi i aktivt stof. Phys. Rev. X 12, 010501 (2022).

    CAS  Google Scholar 

  • Yang, X. et al. Fysisk bioenergetik: energistrømme, budgetter og begrænsninger i celler. Proc. Natl Acad. Sci. USA 118, e2026786118 (2021).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Tan, T. et al. Selvorganiserede stressmønstre driver tilstandsovergange i actin cortex. Sci. Adv. 4, ear2847 (2018).

    Artikel  Google Scholar 

  • Gladrow, J., Fakhri, N., MacKintosh, FC, Schmidt, CF & Broedersz, CP Brudt detaljeret balance mellem filamentdynamik i aktive netværk. Phys. Rev. Lett. 116, 248301 (2016).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Landau, L., Lifshitz, E., Sykes, J., & Reid, W. Teori om elasticitet (Addison-Wesley 1959).

  • Brangwynne, CP, Koenderink, GH, MacKintosh, FC & Weitz, DA Ikke-ligevægt mikrotubulusfluktuationer i et model cytoskelet. Phys. Rev. Lett. 100, 118104 (2008).

    Artikel  Google Scholar 

  • England, JL Dissipativ tilpasning i drevet selvmontering. Nat. Nanoteknologi. 10, 919-923 (2015).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Mizuno, D., Tardin, C., Schmidt, CF & MacKintosh, FC Ikke-ligevægtsmekanik af aktive cytoskeletnetværk. Videnskab 315, 370-373 (2007).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Battle, C. et al. Brudt detaljeret balance på mesoskopiske skalaer i aktive biologiske systemer. Videnskab 352, 604-607 (2016).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Egolf, DA Ligevægt genvundet: fra ikke-ligevægtskaos til statistisk mekanik. Videnskab 287, 101-104 (2000).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Prost, J., Jülicher, F. & Joanny, JF. Aktiv gelfysik. Nat. Phys. 11, 111-117 (2015).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • O'Byrne, J., Kafri, Y., Tailleur, J. & van Wijland, F. Tidsirreversibilitet i aktivt stof, fra mikro til makro. Nat. Rev. Phys. 4, 167-183 (2022).

    Artikel  Google Scholar 

  • Gnesotto, FS, Mura, F., Gladrow, J. & Broedersz, CP Brudt detaljeret balance og ikke-ligevægtsdynamik i levende systemer: en gennemgang. Rep. Prog. Phys. 81, 066601 (2018).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Fakhri, N. et al. Højopløselig kortlægning af intracellulære udsving ved hjælp af kulstof nanorør. Videnskab 344, 1031-1035 (2014).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Fakhri, N., Tsyboulski, DA, Cognet, L., Weisman, RB & Pasquali, M. Diameterafhængig bøjningsdynamik af enkeltvæggede kulstofnanorør i væsker. Proc. Natl Acad. Sci. USA 106, 14219-14223 (2009).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Fakhri, N., MacKintosh, FC, Lounis, B., Cognet, L. & Pasquali, M. Brownsk bevægelse af stive filamenter i et overfyldt miljø. Videnskab 330, 1804-1807 (2010).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Murrell, MP & Gardel, ML F-aktin buckling koordinerer kontraktilitet og afskæring i en biomimetisk actomyosin cortex. Proc. Natl Acad. Sci. USA 109, 20820-20825 (2012).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Weiss, JB Koordinatinvarians i stokastiske dynamiske systemer. Tellus A 55, 208-218 (2003).

    Artikel  Google Scholar 

  • Crooks, GE Entropiproduktionsudsvingssætning og ikke-ligevægtsarbejdsrelationen for fri energiforskelle. Phys. Rev. E 60, 2721-2726 (1999).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Ro, S. et al. Modelfri måling af lokal entropiproduktion og ekstraherbart arbejde i aktivt stof. Phys. Rev. Lett. 129, 220601 (2022).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Harunari, P. E., Dutta, A., Polettini, M. & Roldán, É. What to learn from a few visible transitions’ statistics? Phys. Rev. X 12, 041026 (2022).

    CAS  Google Scholar 

  • van der Meer, J., Ertel, B. & Seifert, U. Termodynamisk inferens i delvist tilgængelige Markov-netværk: et samlende perspektiv fra overgangsbaserede ventetidsfordelinger. Fortryk kl https://arxiv.org/abs/2203.07427 (2022).

  • van der Meer, J., Degünther, J. & Seifert, U. Tidsløst statistik over uddrag som generel ramme for modelfri entropi-estimatorer. Fortryk kl https://arxiv.org/abs/2211.17032 (2022).

  • Roldán, E., Barral, J., Martin, P., Parrondo, JMR & Jülicher, F. Kvantificering af entropiproduktion i aktive fluktuationer af hårcellebundtet fra tidsirreversibilitet og usikkerhedsrelationer. Ny J. Phys. 23, 083013 (2021).

    Artikel  Google Scholar 

  • Tucci, G. et al. Modellering af aktive ikke-markovske svingninger. Phys. Rev. Lett. 129, 030603 (2022).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Skinner, DJ & Dunkel, J. Forbedrede grænser for entropiproduktion i levende systemer. Proc. Natl Acad. Sci. USA 118, e2024300118 (2021).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Weiss, JB, Fox-Kemper, B., Mandal, D., Nelson, AD & Zia, RKP Ikke-ligevægtssvingninger, sandsynlighedsvinkelmomentum og klimasystemet. J. Stat. Phys. 179, 1010-1027 (2020).

    Artikel  Google Scholar 

  • Gonzalez, JP, Neu, JC & Teitsworth, SW Eksperimentelle målinger til påvisning af detaljeret balancebrud. Phys. Rev. E 99, 022143 (2019).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Zia, RKP, Weiss, JB, Mandal, D. & Fox-Kemper, B. Manifest og subtil cyklisk adfærd i stabile tilstande uden ligevægt. J. Phys. Konf. Ser. 750, 012003 (2016).

    Artikel  Google Scholar 

  • Li, J., Horowitz, JM, Gingrich, TR & Fakhri, N. Kvantificering af dissipation ved hjælp af fluktuerende strømme. Nat. Commun. 10, 1666 (2019).

    Artikel  Google Scholar 

  • Guo, M. et al. Undersøgelse af cytoplasmaets stokastiske, motordrevne egenskaber ved hjælp af kraftspektrummikroskopi. Cell 158, 822-832 (2014).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • MacKintosh, FC & Levine, AJ Ikke-ligevægtsmekanik og dynamik af motoraktiverede geler. Phys. Rev. Lett. 100, 018104 (2008).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Malik-Garbi, M. et al. Skaleringsadfærd i steady-state kontraherende actomyosin-netværk. Nat. Phys. 15, 509-516 (2019).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • MacKintosh, FC, Käs, J. & Janmey, PA Elasticitet af semifleksible biopolymernetværk. Phys. Rev. Lett. 75, 4425-4428 (1995).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Valentine, MT, Perlman, ZE, Mitchison, TJ & Weitz, DA Mekaniske egenskaber af Xenopus æg cytoplasmatiske ekstrakter. Biophvs. J. 88, 680-689 (2005).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Field, CM, Pelletier, JF & Mitchison, TJ in Metoder i cellebiologi: Cytokinese Vol. 137 (red. Echard, A.) 395–435 (Academic, 2017).

  • Riedl, J. et al. Lifeact: en alsidig markør til at visualisere F-aktin. Nat. Metoder 5, 605-607 (2008).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Chen, DT, Heymann, M., Fraden, S., Nicastro, D. & Dogic, Z. ATP-forbrug af eukaryote flageller målt på enkeltcelleniveau. Biophvs. J. 109, 2562-2573 (2015).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Ruhnow, F., Zwicker, D. & Diez, S. Sporing af enkelte partikler og aflange filamenter med nanometerpræcision. Biophvs. J. 100, 2820-2828 (2011).

    Artikel  CAS  Google Scholar 

  • Tidsstempel:

    Mere fra Natur Nanoteknologi