การอนุมานกิจกรรมที่ไม่สมดุลขึ้นอยู่กับขนาดโดยใช้ท่อนาโนคาร์บอน

Needleman, D. & Dogic, Z. สารออกฤทธิ์ที่ส่วนต่อประสานระหว่างวัสดุศาสตร์และชีววิทยาของเซลล์ แนท. รายได้ Mater. 2, 17048 (2017)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Ramaswamy, S. The mechanics and statistics of active matter. อันนู. รายได้ Condens สสาร สสาร. 1, 323 – 345 (2010)

บทความ  Google Scholar 

Marchetti, M. et al. Hydrodynamics of soft active matter. Rev. Mod. ร่างกาย. 85, 1143 – 1189 (2013)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Bowick, M., Fakhri, N., Marchetti, M. & Ramaswamy, S. Symmetry, thermodynamics, and topology in active matter. สรีรวิทยา รายได้ X 12, 010501 (2022)

CAS  Google Scholar 

Yang, X. et al. Physical bioenergetics: energy fluxes, budgets, and constraints in cells. พร Natl Acad วิทย์ สหรัฐอเมริกา 118, e2026786118 (2021)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Tan, T. et al. Self-organized stress patterns drive state transitions in actin cortices. วิทย์. โฆษณา 4, ear2847 (2018).

บทความ  Google Scholar 

Gladrow, J., Fakhri, N., MacKintosh, F. C., Schmidt, C. F. & Broedersz, C. P. Broken detailed balance of filament dynamics in active networks. ร่างกาย. Rev. Lett. 116, 248301 (2016)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Landau, L., Lifshitz, E., Sykes, J., & Reid, W. ทฤษฎีความยืดหยุ่น (Addison-Wesley 1959).

Brangwynne, C. P., Koenderink, G. H., MacKintosh, F. C. & Weitz, D. A. Nonequilibrium microtubule fluctuations in a model cytoskeleton. ร่างกาย. Rev. Lett. 100, 118104 (2008)

บทความ  Google Scholar 

England, J. L. Dissipative adaptation in driven self-assembly. แนท. นาโนเทคโนโลยี. 10, 919 – 923 (2015)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Mizuno, D., Tardin, C., Schmidt, C. F. & MacKintosh, F. C. Nonequilibrium mechanics of active cytoskeletal networks. วิทยาศาสตร์ 315, 370 – 373 (2007)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Battle, C. et al. Broken detailed balance at mesoscopic scales in active biological systems. วิทยาศาสตร์ 352, 604 – 607 (2016)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Egolf, D. A. Equilibrium regained: from nonequilibrium chaos to statistical mechanics. วิทยาศาสตร์ 287, 101 – 104 (2000)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Prost, J., Jülicher, F. & Joanny, J-F. Active gel physics. แนท. สรีรวิทยา 11, 111 – 117 (2015)

บทความ  CAS  Google Scholar 

O’Byrne, J., Kafri, Y., Tailleur, J. & van Wijland, F. Time irreversibility in active matter, from micro to macro. แนท. รายได้ พล. 4, 167 – 183 (2022)

บทความ  Google Scholar 

Gnesotto, FS, Mura, F., Gladrow, J. & Broedersz, CP ความสมดุลโดยละเอียดและพลวัตที่ไม่สมดุลในระบบสิ่งมีชีวิต: บทวิจารณ์ ตัวแทน Prog. สรีรวิทยา 81, 066601 (2018)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Fakhri, N. et al. High-resolution mapping of intracellular fluctuations using carbon nanotubes. วิทยาศาสตร์ 344, 1031 – 1035 (2014)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Fakhri, N., Tsyboulski, D. A., Cognet, L., Weisman, R. B. & Pasquali, M. Diameter-dependent bending dynamics of single-walled carbon nanotubes in liquids. พร Natl Acad วิทย์ สหรัฐอเมริกา 106, 14219 – 14223 (2009)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Fakhri, N., MacKintosh, F. C., Lounis, B., Cognet, L. & Pasquali, M. Brownian motion of stiff filaments in a crowded environment. วิทยาศาสตร์ 330, 1804 – 1807 (2010)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Murrell, M. P. & Gardel, M. L. F-actin buckling coordinates contractility and severing in a biomimetic actomyosin cortex. พร Natl Acad วิทย์ สหรัฐอเมริกา 109, 20820 – 20825 (2012)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Weiss, J. B. Coordinate invariance in stochastic dynamical systems. Tellus A 55, 208 – 218 (2003)

บทความ  Google Scholar 

Crooks, G. E. Entropy production fluctuation theorem and the nonequilibrium work relation for free energy differences. ร่างกาย. รายได้ E 60, 2721 – 2726 (1999)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Ro, S. et al. Model-free measurement of local entropy production and extractable work in active matter. ร่างกาย. Rev. Lett. 129, 220601 (2022)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Harunari, P. E., Dutta, A., Polettini, M. & Roldán, É. What to learn from a few visible transitions’ statistics? สรีรวิทยา รายได้ X 12, 041026 (2022)

CAS  Google Scholar 

van der Meer, J., Ertel, B. & Seifert, U. Thermodynamic inference in partially accessible Markov networks: a unifying perspective from transition-based waiting time distributions. Preprint at https://arxiv.org/abs/2203.07427 (2022)

van der Meer, J., Degünther, J. & Seifert, U. Time-resolved statistics of snippets as general framework for model-free entropy estimators. Preprint at https://arxiv.org/abs/2211.17032 (2022)

Roldán, E., Barral, J., Martin, P., Parrondo, J. M. R. & Jülicher, F. Quantifying entropy production in active fluctuations of the hair-cell bundle from time irreversibility and uncertainty relations. นิว เจ ฟิส 23, 083013 (2021)

บทความ  Google Scholar 

Tucci, G. et al. Modeling active non-Markovian oscillations. ร่างกาย. Rev. Lett. 129, 030603 (2022)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Skinner, D. J. & Dunkel, J. Improved bounds on entropy production in living systems. พร Natl Acad วิทย์ สหรัฐอเมริกา 118, e2024300118 (2021)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Weiss, J. B., Fox-Kemper, B., Mandal, D., Nelson, A. D. & Zia, R. K. P. Nonequilibrium oscillations, probability angular momentum, and the climate system. เจ สเตท ฟิสิกส์ 179, 1010 – 1027 (2020)

บทความ  Google Scholar 

Gonzalez, J. P., Neu, J. C. & Teitsworth, S. W. Experimental metrics for detection of detailed balance violation. ร่างกาย. รายได้ E 99, 022143 (2019)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Zia, R. K. P., Weiss, J. B., Mandal, D. & Fox-Kemper, B. Manifest and subtle cyclic behavior in nonequilibrium steady states. เจ. ฟิสิกส์. ประชุม เซอร์ 750, 012003 (2016)

บทความ  Google Scholar 

Li, J., Horowitz, J. M., Gingrich, T. R. & Fakhri, N. Quantifying dissipation using fluctuating currents. ชัยนาท commun 10, 1666 (2019)

บทความ  Google Scholar 

Guo, M. et al. Probing the stochastic, motor-driven properties of the cytoplasm using force spectrum microscopy. เซลล์ 158, 822 – 832 (2014)

บทความ  CAS  Google Scholar 

MacKintosh, F. C. & Levine, A. J. Nonequilibrium mechanics and dynamics of motor-activated gels. ร่างกาย. Rev. Lett. 100, 018104 (2008)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Malik-Garbi, M. et al. Scaling behaviour in steady-state contracting actomyosin networks. แนท. สรีรวิทยา 15, 509 – 516 (2019)

บทความ  CAS  Google Scholar 

MacKintosh, F. C., Käs, J. & Janmey, P. A. Elasticity of semiflexible biopolymer networks. ร่างกาย. Rev. Lett. 75, 4425 – 4428 (1995)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Valentine, M. T., Perlman, Z. E., Mitchison, T. J. & Weitz, D. A. Mechanical properties of ซีโนปุส egg cytoplasmic extracts. Biophys เจ 88, 680 – 689 (2005)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Field, C. M., Pelletier, J. F. & Mitchison, T. J. in Methods in Cell Biology: Cytokinesis Vol. 137 (ed. Echard, A.) 395–435 (Academic, 2017).

Riedl, J. et al. Lifeact: a versatile marker to visualize F-actin. ชัยนาท วิธีการ 5, 605 – 607 (2008)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Chen, D. T., Heymann, M., Fraden, S., Nicastro, D. & Dogic, Z. ATP consumption of eukaryotic flagella measured at a single-cell level. Biophys เจ 109, 2562 – 2573 (2015)

บทความ  CAS  Google Scholar 

Ruhnow, F., Zwicker, D. & Diez, S. Tracking single particles and elongated filaments with nanometer precision. Biophys เจ 100, 2820 – 2828 (2011)

บทความ  CAS  Google Scholar