Une plateforme facile à utiliser est une passerelle vers l'IA en microscopie

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Exemple illustrant comment AI via ZeroCostDL4Mic peut être utilisé pour détecter le noyau de cellules cancéreuses à partir d'images de microscopie. Image du haut: Image microscopique originale. Image du bas: Image où chaque cellule cancéreuse détectée a une couleur différente. Photos: Guillaume Jacquemet.

Résumé:
Un logiciel utilisant l'intelligence artificielle, l'IA, révolutionne la façon dont les images de microscopie sont analysées. Par exemple, l'IA peut être utilisée pour détecter les caractéristiques des images (c'est-à-dire les tumeurs dans les échantillons de biopsie) ou améliorer la qualité des images en supprimant les bruits indésirables. Cependant, les non-experts continuent de trouver les technologies d'IA difficiles à utiliser.

Une plate-forme facile à utiliser est une passerelle vers l'IA en microscopie

Turku, Finlande | Publié le 23 avril 2021

Dans l'article «Démocratiser l'apprentissage profond pour la microscopie avec ZeroCostDL4Mic», publié dans Nature Communications le 15 avril 2021, les chercheurs décrivent une plateforme appelée ZeroCostDL4Mic, qui rend ces technologies d'IA accessibles à tous.

«La principale nouveauté est que ZeroCostDL4Mic s'exécute gratuitement dans le cloud et n'exige pas que les utilisateurs aient une expérience de codage ou des compétences informatiques avancées. En effet, il fonctionne sur n'importe quel ordinateur équipé d'un navigateur Web », explique Guillaume Jacquemet, chercheur principal en biologie cellulaire à l'Université Åbo Akademi.

Au cours des 400 dernières années, les microscopes ont permis à l'humanité d'observer des objets qui seraient autrement trop petits pour être vus à l'œil nu. Aujourd'hui, la microscopie est une technologie de pointe utilisée dans le monde entier pour effectuer non seulement des recherches, mais également des diagnostics.

Les microscopes modernes sont directement connectés aux appareils photo numériques, conduisant à l'acquisition de centaines à des milliers d'images par échantillon. Ces images doivent être traitées sur un ordinateur pour obtenir des données significatives, ce qui est une entreprise colossale.

Pour aider avec le nombre d'images, Jacquemet et ses collègues ont utilisé l'IA pour entraîner une machine à faire le travail. En pratique, ZeroCostDL4Mic est une collection de blocs-notes explicites pour Google Colab, avec une interface utilisateur graphique facile à utiliser.

«Nous pensons que ZeroCostDL4Mic agira comme 'un médicament de passerelle' pour l'IA, incitant les utilisateurs à explorer ces nouvelles technologies qui transformeront la recherche biomédicale et le diagnostic dans les décennies à venir», déclare Jacquemet.

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Le développement de la plateforme ZeroCostDL4Mic a été coordonné par les laboratoires de Guillaume Jacquemet (Université Åbo Akademi, Turku, Finlande) et Ricardo Henriques (Instituto Gulbenkian de Ciência, Oeiras, Portugal). Il impliquait un grand consortium international regroupant 12 laboratoires, répartis dans neuf pays et deux continents.

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Contacts :
Guillaume Jacquemet
358-503-235-606

@aboakademi

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