استنتاج نشاط غير متوازن يعتمد على المقياس باستخدام الأنابيب النانوية الكربونية

Needleman، D. & Dogic، Z. مادة نشطة في التفاعل بين علم المواد وبيولوجيا الخلية. نات. القس ماتر. 2، 17048 (2017).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Ramaswamy, S. The mechanics and statistics of active matter. Annu. القس المكثف. مسألة فيز. 1، 323 – 345 (2010).

مقالة  الباحث العلمي من Google 

Marchetti, M. et al. Hydrodynamics of soft active matter. القس Mod. فيز. 85، 1143 – 1189 (2013).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Bowick, M., Fakhri, N., Marchetti, M. & Ramaswamy, S. Symmetry, thermodynamics, and topology in active matter. فيز. القس العاشر 12، 010501 (2022).

CAS  الباحث العلمي من Google 

Yang, X. et al. Physical bioenergetics: energy fluxes, budgets, and constraints in cells. بروك. ناتل أكاد. الخيال العلمي. الولايات المتحدة الأمريكية 118و e2026786118 (2021).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Tan, T. et al. Self-organized stress patterns drive state transitions in actin cortices. علوم. حال. 4، eaar2847 (2018).

مقالة  الباحث العلمي من Google 

Gladrow, J., Fakhri, N., MacKintosh, F. C., Schmidt, C. F. & Broedersz, C. P. Broken detailed balance of filament dynamics in active networks. فيز. القس ليت. 116، 248301 (2016).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Landau, L., Lifshitz, E., Sykes, J., & Reid, W. Theory of Elasticity (Addison-Wesley 1959).

Brangwynne, C. P., Koenderink, G. H., MacKintosh, F. C. & Weitz, D. A. Nonequilibrium microtubule fluctuations in a model cytoskeleton. فيز. القس ليت. 100، 118104 (2008).

مقالة  الباحث العلمي من Google 

England, J. L. Dissipative adaptation in driven self-assembly. نات. تقنية النانو. 10، 919 – 923 (2015).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Mizuno, D., Tardin, C., Schmidt, C. F. & MacKintosh, F. C. Nonequilibrium mechanics of active cytoskeletal networks. علوم 315، 370 – 373 (2007).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Battle, C. et al. Broken detailed balance at mesoscopic scales in active biological systems. علوم 352، 604 – 607 (2016).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Egolf, D. A. Equilibrium regained: from nonequilibrium chaos to statistical mechanics. علوم 287، 101 – 104 (2000).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Prost, J., Jülicher, F. & Joanny, J-F. Active gel physics. نات. فيز. 11، 111 – 117 (2015).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

O’Byrne, J., Kafri, Y., Tailleur, J. & van Wijland, F. Time irreversibility in active matter, from micro to macro. نات. القس فيز. 4، 167 – 183 (2022).

مقالة  الباحث العلمي من Google 

Gnesotto ، FS ، Mura ، F. ، Gladrow ، J. & Broedersz ، CP Broken التوازن التفصيلي وديناميات عدم التوازن في الأنظمة الحية: مراجعة. النائب بروغ. فيز. 81، 066601 (2018).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Fakhri, N. et al. High-resolution mapping of intracellular fluctuations using carbon nanotubes. علوم 344، 1031 – 1035 (2014).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Fakhri, N., Tsyboulski, D. A., Cognet, L., Weisman, R. B. & Pasquali, M. Diameter-dependent bending dynamics of single-walled carbon nanotubes in liquids. بروك. ناتل أكاد. الخيال العلمي. الولايات المتحدة الأمريكية 106، 14219 – 14223 (2009).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Fakhri, N., MacKintosh, F. C., Lounis, B., Cognet, L. & Pasquali, M. Brownian motion of stiff filaments in a crowded environment. علوم 330، 1804 – 1807 (2010).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Murrell, M. P. & Gardel, M. L. F-actin buckling coordinates contractility and severing in a biomimetic actomyosin cortex. بروك. ناتل أكاد. الخيال العلمي. الولايات المتحدة الأمريكية 109، 20820 – 20825 (2012).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Weiss, J. B. Coordinate invariance in stochastic dynamical systems. Tellus A 55، 208 – 218 (2003).

مقالة  الباحث العلمي من Google 

Crooks, G. E. Entropy production fluctuation theorem and the nonequilibrium work relation for free energy differences. فيز. القس E 60، 2721 – 2726 (1999).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Ro, S. et al. Model-free measurement of local entropy production and extractable work in active matter. فيز. القس ليت. 129، 220601 (2022).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Harunari, P. E., Dutta, A., Polettini, M. & Roldán, É. What to learn from a few visible transitions’ statistics? فيز. القس العاشر 12، 041026 (2022).

CAS  الباحث العلمي من Google 

van der Meer, J., Ertel, B. & Seifert, U. Thermodynamic inference in partially accessible Markov networks: a unifying perspective from transition-based waiting time distributions. Preprint at https://arxiv.org/abs/2203.07427 (2022).

van der Meer, J., Degünther, J. & Seifert, U. Time-resolved statistics of snippets as general framework for model-free entropy estimators. Preprint at https://arxiv.org/abs/2211.17032 (2022).

Roldán, E., Barral, J., Martin, P., Parrondo, J. M. R. & Jülicher, F. Quantifying entropy production in active fluctuations of the hair-cell bundle from time irreversibility and uncertainty relations. جديد J. Phys. 23، 083013 (2021).

مقالة  الباحث العلمي من Google 

Tucci, G. et al. Modeling active non-Markovian oscillations. فيز. القس ليت. 129، 030603 (2022).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Skinner, D. J. & Dunkel, J. Improved bounds on entropy production in living systems. بروك. ناتل أكاد. الخيال العلمي. الولايات المتحدة الأمريكية 118و e2024300118 (2021).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Weiss, J. B., Fox-Kemper, B., Mandal, D., Nelson, A. D. & Zia, R. K. P. Nonequilibrium oscillations, probability angular momentum, and the climate system. J. ستات. فيز. 179، 1010 – 1027 (2020).

مقالة  الباحث العلمي من Google 

Gonzalez, J. P., Neu, J. C. & Teitsworth, S. W. Experimental metrics for detection of detailed balance violation. فيز. القس E 99، 022143 (2019).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Zia, R. K. P., Weiss, J. B., Mandal, D. & Fox-Kemper, B. Manifest and subtle cyclic behavior in nonequilibrium steady states. J. فيز. أسيوط. سر. 750، 012003 (2016).

مقالة  الباحث العلمي من Google 

Li, J., Horowitz, J. M., Gingrich, T. R. & Fakhri, N. Quantifying dissipation using fluctuating currents. نات. COMMUN. 10، 1666 (2019).

مقالة  الباحث العلمي من Google 

Guo, M. et al. Probing the stochastic, motor-driven properties of the cytoplasm using force spectrum microscopy. الموبايل 158، 822 – 832 (2014).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

MacKintosh, F. C. & Levine, A. J. Nonequilibrium mechanics and dynamics of motor-activated gels. فيز. القس ليت. 100، 018104 (2008).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Malik-Garbi, M. et al. Scaling behaviour in steady-state contracting actomyosin networks. نات. فيز. 15، 509 – 516 (2019).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

MacKintosh, F. C., Käs, J. & Janmey, P. A. Elasticity of semiflexible biopolymer networks. فيز. القس ليت. 75، 4425 – 4428 (1995).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Valentine, M. T., Perlman, Z. E., Mitchison, T. J. & Weitz, D. A. Mechanical properties of النمو egg cytoplasmic extracts. Biophys. J. 88، 680 – 689 (2005).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Field, C. M., Pelletier, J. F. & Mitchison, T. J. in Methods in Cell Biology: Cytokinesis Vol. 137 (ed. Echard, A.) 395–435 (Academic, 2017).

Riedl, J. et al. Lifeact: a versatile marker to visualize F-actin. نات. أساليب 5، 605 – 607 (2008).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Chen, D. T., Heymann, M., Fraden, S., Nicastro, D. & Dogic, Z. ATP consumption of eukaryotic flagella measured at a single-cell level. Biophys. J. 109، 2562 – 2573 (2015).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google 

Ruhnow, F., Zwicker, D. & Diez, S. Tracking single particles and elongated filaments with nanometer precision. Biophys. J. 100، 2820 – 2828 (2011).

مقالة  CAS  الباحث العلمي من Google